Małgorzata Janas-Kozik, Irena Krupka-Matuszczyk, Małgorzata Stachowicz, Urszula Mazurek Jadłowstręt psychiczny w aspekcie mikromacierzy oligonukleotydowych - badania własne 377-386 Anorexia nervosa with regard to oligonucleotide microarray technique - own data 377-386 Streszczenie Cel pracy: Celem niniejszej pracy było zbadanie profilu ekspresji transkryptów wybranych genów
kodujących receptory leptyny oraz oreksyn A i B metodą mikromacierzy oligonukleotydowych (Affymetrix, HG-U133A) u chorych cierpiących na jadłowstręt psychiczny (Anorexia Nervosa, AN). Materiał i metoda: Analizie poddano jednojądrzaste komórki krwi obwodowej (PBMC) 4 pacjentek cierpiących na jadłowstręt psychiczny spełniających kryteria klasyfikacji wg ICD-10 i DSM IV [14, 15], dwie z nich cierpiały na postać restrykcyjną AN ( AN-R) a dwie na postać bulimiczno-wydalającą AN (AN-BW). Grupę kontrolną stanowiły 4 pacjentki nie chorujące na zaburzenia odżywiania się. Materiałem badanym był RNA wyizolowany z PBMC tych chorych. Otrzymany RNA posłużył do zbadania profilu ekspresji wybranych genów na poziomie transkryptu techniką mikromacierzy oligonukleotydowych (Affymetrix, HG-U133A). W celu analizy otrzymanych wyników zastosowano metodę klasteryzacji hierarchicznej (Cluster v 3.0) dla sześciu, a następnie ośmiu mikromacierzy oligonukleotydowych. Wyniki: Metoda klasteryzacji hierarchicznej wyodrębniła odrębne klastry dla chorych z AN-R i AN-BW oraz pacjentek z grupy kontrolnej. Wnioski: Na podstawie wyników klasteryzacji hierarchicznej przeprowadzonej dla sześciu i ośmiu mikromacierzy oligonukleotydowych przedstawiających odmienne profile ekspresji genów kodujących wybrane białka oreksygeniczne (OXA i OXB) oraz anoreksygeniczne (LEP) możemy przypuszczać, że metoda ta różnicuje dwa typy jadłowstrętu psychicznego: typ restrykcyjny AN (AN-R) i typ bulimiczno - wydalający AN (AN-BW). Summary Aim. The aim of the study was to discover the transcript expression profile of selected genes coding
receptors of leptin and orexin A and B by using the oligonucleotide microarray technique (Affymetrix, HG-U133A) in patients who suffered from anorexia nervosa (AN). Method. The peripheral blood of mononuclear cells (PBMC) of four AN patients complying with the ICD-10 and the AN diagnostic criteria DSM IV [14, 15] were analysed. Two patients suffered from the restricting type of AN (AN-R) and two suffered from the bingeeating/purging type of AN (AN-BP). Four patients were our reference group and
they did not suffer from eating disorders. The material used in the assay was the total RNA which was isolated from the PBMC of patients. The total RNA was used to investigate the transcript expression profile of selected genes by using the oligonucleotide microarray technique (Affymetrix, HG-U133A). For six and for eight oligonucleotide microarrays, the accumulation analysis method was used (clustering, Cluster v 3.0) to analyse the results. Results. Hierarchical clustering resulted in separate clusters for patients who suffered from AN-R, AN-BP and patients from the reference group. Conclusions. Taking into consideration the hierarchical clustering for six and for eight oligonucleotide microarray performing different transcript expression profile of selected genes coding orexigenic peptides (OXA and OXB) and anorexigenic peptides (LEP) we suggest that the oligonucleotide microarray method differentiates two type of anorexia nervosa: the restricting type of AN (AN-R) and the binge-eating/purging type (AN-BP).
|